复旦大学上海医学院研究生院是复旦大学上海医学院领导下的医学研究生教育管理机构,是校学位评定委员会医学部的秘书机构。其主要职能是贯彻落实国家的教育方针,执行国家和学校有关学位与研究生教育工作的政策法规,在学校和上海医学院的统一领导下,对医学学位与研究生教育的改革与发展进行总体规划、统筹管理,负责医学研究生招生工作、学籍管理、培养工作、学位工作及其他综合事务;负责与校研究生院协调相关事务,通过研究生教育的二级管理体制对上海医学院各相关学院及附属医院的研究生教育教学工作进行业务指导、协调服务和监督考评。